Thestakesareraisedinseasontwoof"MI-5",asthethreattonationalsecurityincreasesandtheneedtothwarttheterroristsoperatingwithintheUKbecomesmoreurgent.TomisinvestigatingaSerbianterroristplot.HisgirlfriendandherdaughteraretrappedinTom’shousewithalap-topwhichisthoughttocontainabomb.MeanwhileanotherbombisprimedtoexplodeandthisonekillstheSecretaryofStateforNortheIreland.Addingtothepossibledangersfacedbyothergovementofficials,TomleasfromhisAmericancolleaguethatanassassinisintown,theCIAknowabouthimbuttheyhaven’ttoldMI-5.
电视剧《军情五处》第二季共计36集，讲述了中国军情五处的特工在国际上的秘密行动，以及他们所面对的种种危机与挑战。以下是剧情介绍：
第1-2集，李云飞被指控为间谍，并被送回中国接受审讯。他的同事们决定帮助他洗脱罪名，找出真凶。
第3-4集，军情五处发现有一个正处在起飞状态的美国飞机上有炸弹，但找不到炸弹是放在哪个位置的。他们必须尽快找到炸弹并消除它，以免造成严重后果。
第5-6集，一位中国军事科学家在海外受到了外国势力的诱惑，被要求出卖国家机密和技术。军情五处得到线报并派遣特工跟踪并阻止该举动。
第7-8集，中国一支代表团在墨西哥举行演讲，期望争取更多支持。但是，墨西哥有一个恐怖分子组织——拉丁新天使，他们决定炸毁演讲现场。军情五处必须协助当地警方防止发生恐怖袭击。
第9-10集，一艘中国的渔船在日本海域被日本警察扣留，他们指控该船非法捕捞。然而，该船上的旅客都是中国的游客，这一指控似乎有点牵强。军情五处必须查明真相，帮助这些游客。
第11-12集，一名中国特工在伊朗被捕并遭受拷打。他们必须及时派人营救他。
第13-14集，伊拉克总理来北京进行正式访问。但是，在他的官方车队中发现了一个炸弹。军情五处必须找到这个炸弹，并防止它被引爆。
第15-16集，一名中国商人在非洲被绑架。绑架者声称他们只会向商人的家人提供赎金。军情五处必须及时介入，并防止事态进一步恶化。
第17-18集，一个代表中国的女演员在台湾进行巡演，却意外发现她的前男友在台湾做生意，并涉嫌非法走私。军情五处必须决定是否吸引他前来，并协助当地警方将他逮捕归案。
第19-20集，一名上海市长在美国旧金山参加会议时遇到了枪击案。警方怀疑是中国的商业竞争对手所为，但军情五处必须查明真相。
第21-22集，一名中国侨民在泰国被杀。军情五处必须与当地警方合作调查，并找到真正的凶手。
第23-24集，一名中国学生在美国被绑架，绑架者正在勒索他的家人付款。军情五处必须及时派遣特工救出他，并将绑架者绳之以法。
第25-26集，台湾总统在北京进行国事访问。但是，他收到了恐吓信，说如果他来到北京，就会有不测之。为了保护他的安全，军情五处必须设法防止这个威胁成为现实。
第27-28集，一名中国科学家在美国被绑架，并被要求透露核武器的机密。军情五处必须及时营救他，并防止这些机密被泄露。
第29-30集，一名中国企业家在俄罗斯被绿色和平组织绑架。军情五处必须与俄罗斯当地警方合作，营救这位企业家。
第31-32集，一名中国大使在非洲誓死捍卫自己的言论言论不受侵犯。但是，她收到了死亡威胁。军情五处必须保护她的安全，并防止这个威胁成为现实。
第33-34集，一名中国旅行团在柬埔寨遭到武装事故袭击。军情五处必须寻找幕后黑手，并保护中国游客的安全。
第35-36集，一个中国特工在日本深入搜集情报，结果被日本警察逮捕，并被拘留。军情五处必须派人去营救，并防止中国特工的身份被曝光。